Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms