Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRHQ9HD43 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRHQ9HD43 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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