Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms