Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXP3Q9BZS1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms