Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms