Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms