Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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