Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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