Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms