Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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