Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSPG4P5Q96PW8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms