Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASIC4Q96FT7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms