Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms