Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF3C6Q969F1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms