Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-CQ95604 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms