Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms