Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms