Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms