Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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