Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO38Q6PIJ6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms