Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC174Q6PII3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms