Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms