Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC102BQ68D86 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC102BQ68D86 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms