Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FNDC7Q5VTL7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms