Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MDH1B-201ENST00000374412 2553 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC27A6-202ENST00000395266 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLIN5-206ENST00000592610 1903 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms