Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms