Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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