Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IMPG1Q17R60 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms