Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CA9Q16790 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CA9Q16790 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CA9Q16790 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CA9Q16790 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CA9Q16790 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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