Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms