Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FXNQ16595 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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