Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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