Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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