Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EFNB3Q15768 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms