Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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