Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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