Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms