Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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