Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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