Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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