Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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