Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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