Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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