Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCGQ13326 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCGQ13326 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCGQ13326 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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