Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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