Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms