Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms