Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms