Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL9Q07325 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL9Q07325 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms