Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms